西藏地處泛北極區(qū)系和古熱帶區(qū)系的交匯處,獨特的自然地理位置和復雜多樣的氣候條件,孕育了豐富的植物資源,甚至第四紀冰川期遺留下來的一些植物,在藏東南雅魯藏布大峽谷地區(qū)也有保存,堪稱世界少有的“綠色基因庫”和“自然博物館”。全區(qū)共有高等植物6600多種、藻類植物2376種、真菌878種。在眾多的野生植物資源中,有木本植物1700余種,藥用植物1000余種,油脂、油料植物100余種,芳香油、香料植物180余種,工業(yè)原料植物(含鞣質(zhì)、樹脂、樹膠、纖維植物)300余種,食用、飼用淀粉植物、野生林果植物300余種,園林綠化和觀賞花卉植物達2000余種。食用菌415種,靈芝等藥用菌238種,其中絲膜菌、蟲草等已知有抗癌作用的真菌168種。
受國家重點保護的珍稀植物有38種(其中國家一級保護植物有喜瑪拉雅紅豆杉、玉龍蕨等6種),列入自治區(qū)重點保護植物有四葉紅景天、亞東冷杉等40種,另有214種被列入《瀕危野生動植物種國際貿(mào)易公約》附錄內(nèi)。